氨基酸的極性取決于側(cè)鏈基團,如果側(cè)鏈?zhǔn)遣粚ΨQ的極性基團,這個氨基酸就是極性氨基酸.
極性氨基酸包括：帶電荷的五種,再加上Gly,Ser,Thr,Cys,Asn,Gln,Tyr.帶有羥基、巰基、酰胺等極性基團,自然就是極性的.如果側(cè)鏈只是碳、氫構(gòu)成的烴鏈,就是非極性的.
一般說來,極性和親水是一致的,但對于氨基酸,則不能籠統(tǒng)地說,“極性氨基酸可看作是溶于水的氨基酸,反之,則不易溶于水”.如果說非極性基團或側(cè)鏈不溶于水還差不多.因為氨基酸本身是兩性離子,所以多數(shù)氨基酸都是可溶的,包括非極性氨基酸.非極性氨基酸整個分子還是極性的,只有側(cè)鏈?zhǔn)欠菢O性的.