總的來說,食用菌與后三者都是既有互利關(guān)系又有互害的關(guān)系.
食用菌與動(dòng)物之間關(guān)系：動(dòng)物既是食用菌孢子傳播的媒介或是兩者具有共生關(guān)系,如白蟻和雞樅菌,同時(shí)動(dòng)物也是給食用菌傳播雜菌和害蟲的媒介；
食用菌與植物的關(guān)系：植物可以為食用菌提供養(yǎng)料、氧氣、遮陰環(huán)境,而食用菌可以為其提供二氧化碳,分解植物殘?bào)w,也有可能導(dǎo)致樹木病害的發(fā)生,兩者還可以共生形成菌根；
食用菌與微生物的關(guān)系：食用菌屬于真菌,自然也屬于微生物范疇,其他的微生物既可以為食用菌制作發(fā)酵料,有的還能刺激食用菌出菇,還有兩者之間呈伴生關(guān)系的；與此同時(shí),有的微生物還會(huì)污染培養(yǎng)基,爭奪營養(yǎng)物質(zhì),侵染食用菌,導(dǎo)致各種病害.