A．孟德爾選用的實驗材料--豌豆是嚴格的自花、閉花受粉作物，實驗結果可靠又易于分析，這是他研究的特點，也是他研究成功的原因之一，A正確．
B．孟德爾動物數學方法--數學統(tǒng)計，用統(tǒng)計學的方法得出了雜交或自交后代出現一定的分離比，這是對多數個體及后代統(tǒng)計的結果，有助于孟德爾總結數據規(guī)律，B正確．
C．孟德爾通過測交實驗不僅證明了自己的假說，而且用可見的測交實驗的結果，C正確．
D．等位基因分離，體現了分離定律的實質，在等位基因分離的同時，非同源染色體上的非等位基因自由組合，體現了自由組合定律的實質．假說中具有不同基因型的配子之間隨機結合，不能體現自由組合定律的實質，D錯誤．
故答：D．